申请办理ISO9001品质体系认证有5个程序流程，操作步骤如下所示：
一、申请者递交一份正规的应当由其法定代理人签订的申请报告。申请报告或者其配件一般包括：
1）申请方概况，如机构的特性、名字、详细地址、诉讼地位、及相关的人力资源和现代信息技术。
2）认证的覆盖产品和服务范畴。
3）法人代表营业执照复印件，如果需要给予资质证书、生产许可影印件。
4）咨询管理公司和资询成员名单。
5）近一次我国产品质量监督检查情况。
6）相关质量管理体系及主题活动的一般信息内容。
7）申请者允许遵循验证规定，给予点评所需的信息内容。
8）对拟认证标准所适用规范别的引用文件表明。
二、认证机构依据申请者的需要提交相关公布文档。
三、认证机构在接到申请方申报材料之日起，经合同评审之后30日内做出审理、不予受理或完善后办理的确定，并告知受托人（受审核方）。以保证：认证各项规定要求确立，产生文档并获得了解；认证机构与申请方中间在分析上的差别及时解决;针对申请方办理的认证体系，运行场地及一些特别要求，如申请方应用的言语等，认证有实力执行验证；如果需要认证机构规定受审核方补充材料和表明。
四、彼此签署“质量认证体系合同书”当某一特定的验证方案或验证规定必须做出解释时，由认证机构意味着承担按认可机构承认的文档开展表述，同时向有关部门公布。
五、对收到信息内容将用以现场确认评定提前准备。认证机构服务承诺信息保密并保管好。